J.H.JIN의 모든 글

Fluorescence microscopy

형광 현미경 관찰법 (검경법)

Fluorescence Microscopy

  • 물체에 강한 빛을 조사할 때 발현되는 형광을 이용하여 물체의 구조를 관찰하거나 형광의 유무와 색조를 이용하여 물질을 판별한는 현미경입니다.
  • 발현되는 형광의 양을 측광하여 물질의 특성을 파악하고자 하는 경우에도 사용되고 있습니다.
  • 일반 생물 현미경은 주로 투과 조명을 사용합니다만, 근래의 형광현미경은 주로 반사조명을 사용하고 있습니다.

형광 현미경 샘플 이미지 ( by J.H.JIN )

Fluorochrome
( Fluorophores or Fluorescent Probes)

형광은 특정 파장의 빛을 흡수하는 동시에 다른 파장(흡수 파장보다 긴 파장), 작은 에너지의 빛을 반사하는 분자현상입니다. 이 과정은 excitation(여기) 와 emission(방출, 발광) 으로 알려져 있습니다.

유기 및 비유기의 많은 물질들은 형광 특성을 가지고 있습니다. 형광 현미경을 사용하는 초기의 현미경 학자들은 1차 형광 또는 자가 형광을 주로 보았으나, 지금은 매우 밝은 형광을 가지는 많은 염료(fluorochrome)가 개발되었고 이는 시편의 특정 부분을 염색하는데 사용이 됩니다. 이러한 방법은 2차 혹은 간접 형광이라고 합니다.

이러한 염료는 형광색소(Fluorochrome) 라고 하는데, 항체와 핵산과 같은 다른 유기 합성 물질을 결합할 때는 fluorescent probes 혹은 fluorophores로 불려집니다. (하지만, 일반적으로 이러한 용어들은 종종 같은 의미로 사용되어 지고 있습니다. )

형광 현미경의 구조 및 형광의 특성

형광 현미경 ( 좌 ) 과 명시야 현미경 ( 우 ) 의 광로 비교

  • 형광을 발현하기 위해서는 빛이 흡수가 필요합니다.
  • 형광은 여기광의 입사방향과 관계없이 모든 방향으로 발현합니다.
  • 일반적으로 형광의 강도는 여기광에 비교하여 매우 약합니다.
  • 형광 파장은 여기광과 관계없이 일정합니다.
  • 형광의 파장은 여기광(흡수광)의 파장보다 깁니다.(Stroke’s law)
  • 형광은 정도의 차는 있지만 소광 또는 퇴색합니다.

응용분야 로는

  • 의학,치학,약학 생물학의 기초연구 등
  • 임상위생검사, 가축위생, 식물내해 등의 시험연구 등
  • 화학, 약품, 반도체관련 등의 공업분야에서도 넓게 사용되어지고 있다.

Simple Polarization

간이 편광(Simple Po)

Simple Polarization  

Simple Polarization (원리 설명)

본 관찰법은 편광필터 2개(편광자, 검광자)로 이루어진다.

Simple-Polarization_Cross-Nicols
직교니콜에서는 편광판과 검광판의 편광 방향이 수직으로 교차하여 빛이 차단되고, 평행 니콜에서는 두 편광 방향이 평행하여 빛이 통과한다.

상기 이미지와 같이 편광자와 검광자가 90도 각도로 설치 되어 있는 상태를 흔히 직교니콜(Cross Nicol)이라고 불리며, 현미경에서의 주요 사용 목적은 광학적 특성의 변화가 있는 빛만을 통과시키고자 할 때 자주 사용된다.

일반적으로 빛은 모든 방향으로 진동하는 특성을 가지고 있으나, 세로 방향 편광자(좌측필터)를 통한 빛은 세로로 진동하는 빛만이 통과하게 되고, 가로 방향 검광자(우측필터)는 세로로 진동하는 빛을 차단하는 역할을 하기 때문에 실제로 우측으로 투과되는 빛은 없다. (실제로는 Cross Nicol 상태에서도 미약한 광은 투과되지만, 매우 약하기 때문에 없다고 표현하고 있습니다.)

등방체 재질의 샘플의 경우 편광자와 검광자 사이에서 광학적 특성에 변화를 줄 수 없기 때문에 Cross Nicol 관찰에서 어두운 이미지가 얻어진다.

참고로 등방체가 아닌 물질인 플라스틱 등은 편광자를 통과하여 얻은 편광된 빛에 큰 영향을 주기 때문에 이를 염두에 두고 사용하여야 한다.

예를들어 미분간섭 관찰(DIC)은 Cross Nicol 된 상태를 기반으로 설계된 관찰법입니다만, 등방체가 아닌 플라스틱과 같은 재질이  광학 경로상에 있으면 편광에 큰 변화를 주어 DIC 광학 설계를 무의미하게 만들어 버립니다.

JNO-TPL ( 투과 현미경용 편광자 )
JNO-TPL
투과 현미경용 편광자
Polarizer for Transmitted Microscopy

Dark Field

암시야 현미경 관찰법

Dark Field Microscopy (Transmitted & Reflected)
명시야(BF) 이미지와 암시야(DF) 이미지의 비교
투과 현미경에서 보는 Bright filed Image & Dark Field Image

암시야 (Dark field ) 검경법 의 특징

  • 스크래치나 단차, 파티클을 강조하는 관찰법
  • 샘플에 닿는 직접 조명광은 밖으로 유도하고, 오로지 샘플에서 나오는 산란광 만을 대물렌즈로 취하는 관찰법
  • 배경이 어두운 상태에서 샘플이 반짝이기 때문에 현미경의 분해능을 넘어서는 관찰이 가능하다. 

생물 (Bio) 현미경

투과 조명 _ Bright Field 와 Dark Field 

산업(금속) 현미경

반사조명 _ Bright Field 와 Dark Field 

Bright Field

명시야 현미경 관찰법 설명

Bright Field Microscopy

반사조명이미지
반사조명 이미지

Bright Field 관찰법 발명자 정보

  Bright Field 관찰법은 현미경 관찰의 시작이라고 할 수 있습니다. 샘플을 확대하는 등의 여러 발명은 아주 오랜 전 부터 기록을 볼 수 있었으며,  1590년대의 네덜란드인 얀센 (Zacharias Jansen)이 현재의 현미경과 같은 구조의 현미경을 제작하였고, 그 이후로 현대에 이르기까지 다양한 관찰법의 시작점으로 사용되어 지고 있습니다.  

Bright Field 현미경의 개요

가장 기본이 되는 관찰법. 
금속 또는 산업현미경
  • 대부분의 샘플이 불투명하여 반사조명을 주로 사용
생물 현미경
  • 대부분의 샘플이 투명하여 투과조명을 주로 사용 

필요에 따라서 반사와 투과 조명을 동시에 사용하는 경우도 있음.

반사 현미경과 투과현미경에서 조명 차이

  • Bright Field 현미경의 설명

샘플을 단순 확대 관찰 용도이며,  특수한 광학유닛을 필요로 하지 않는 기본 관찰 방법입니다. 현미경에서 사용되는 조명계는 과거에는 Critical illumination을 사용하였으나, 현재에 판매되는 대부분의 현미경의 조명계는 쾰러 일루미네이션(Köhler illumination )을 사용하고 있습니다.

 조명에 의해 만들어 지는 결상계와 샘플에 의해 만들어지는 결상계가 서로 영향을 미치지 않도록 설계되어 있으며, 조명의 결상에 의해 발생하는 샘플의 이미지 저하를 최소화 한 조명계입니다.

critical illumination : 예전에 사용하였던 조명 방법으로 조명의 결상계과 샘플의 결상계가 서로 중복 결상되도록 되어 있어서, 샘플의 관찰을 할 때 조명의 상과 샘플의 상이 중복되어 관찰되어 이미지의 저하가 발생합니다.  

수차(aberration)의 종류

자이델의 5수차 (The Five Seidel Aberrations )
  • Spherical Aberration ( 구면수차 )
  • Coma ( 혜성형 수차 )
  • Astigmatism ( 비점수차 )
  • Curvature of field ( 상면만곡 ) _ 대물렌즈의 보정 표시 ( PLAN )
  • Distortion ( 왜곡 )
색수차 ( Chromatic aberration )

가시광선 대역에 있어서 파장이 짧은 보라색의 빛과 파장이 긴 붉은색의 빛의 굴절율을 보면 파장이 짧을 수록 렌즈를 통과한 후의 굴절율이 크고, 파장이 길수록 굴절율이 작아지기 때문에 하나의 렌즈로 빛을 결상하고자 할때 파장에 따라 결상 위치에 차이를 발생하게 됩니다. 일반적으로 현미경에서 사용되는 대물렌즈는 이러한 색수차에 의한 문제점을 보정 하는 정도로 다음과 같이 대물렌즈의 등급을 분류하고 있습니다.

  • Achromat – 저가형 현미경에 주로 사용되어지는 렌즈
  • Flourite ( Semi-Apo ) – 현업에서 많이 사용되는 범용 렌즈
  • Apochromat – 고급 렌즈로 가격이 가장 비싼 렌즈

JNO-DPTS

Multi-Dual Port ( Simultaneously Observation )

Download  Catalog  JNO-DPTS

To observe Fluorescence image  and IR DIC image  at the same time
with Multi-Dual Port tube for BX51-WI
(Made by Jae Hwan JIN )

JNO-DPTS JNOPTIC Multi-Dual Port System
JNO-DPTS JNOPTIC Multi-Dual Port System
  1. Simultaneously Observation
Optical path of JNO-DPTS
Optical path of JNO-DPTS IR-DIC 이미지는 투과 되고, Visivle 이미지 반사되어 각각의 카메라로 전달 된다.

CA3 pyramidal neuron, IR-DIC & Alexa Fluor 488 (50 uM)

1FullF6_2
1FullF6_2
CA3 pyramid neurons taken with JNO-DPTS
CA3 pyramidal neuron Alexa Fluor 488, IR-DIC (Simultaneous observations)
Figure courtesy by Dr. Sooyun Kim, Seoul National University
CA3 pyramid neurons taken with JNO-DPTS
CA3 pyramidal neuron AcquCAM 23S2 & JNO-RNB filter with BX51WI
CA3 pyramid neurons taken with JNO-DPTS
CA3 pyramidal neuron AcquCAM 23S2 & JNO-RNB filter with BX51WI
Frame Rate162 fps, increased through ROI
Sensor1 / 1.2 inch ( 1920×1200, 5.86㎛ x 5.86㎛ )
FILTERJNO-RemN/B (Noisy cut filter)
Manification1x, 1.25x, 1.6x, 2x

JNO-ARM

Advance Realtime Monitor. Easy-to-Use, Image Enhancement, etc

1. Information

ARM is image analysis software for JNOPTIC AcquCAM cameras. This S/W is interchangeable with all WDM cameras regardless of camera brand and model and even more the most strength point is simple and easy use of length, area, angle, etc.ARM01

2. Simple measurement tools

toolbar

  • Measurement Tools: Count, Distance, Angle, Area, etc.
  • Guide Lines: Cross Line, Rectangular Lattice, Circular Grid
  • Scale Panel on Live/Image Screen
  • Available measurement on LIVE image and saved image mode

3-1. Specialization for observation of fluorescence images

Improvement Function about Fluorescence Microscopy Image. (Used function: Auto Level, Low level, Pseudo Color, Merge Image)
ARM02
 Bottom on the left is merged image without improvement of image. And the bottom on the right is merged image after improvement of image. These images are shot by JNOPTIC AcquCAM Pro/G3 camera

3-2-1 Effect of high-contrast image with simple operation (Monochrome)

Improvement Function about Microscopy Image Monochrome. (Used function: Auto Level)arm04Effective improvement of image with simple operation. This image is shot by JNOPTIC Pro/S3 camera

3-2-2 Effect of high-contrast image with simple operation (Color)

Improvement Function about Microscopy Image. (Used function: Auto Level)arm05Effective improvement of image with simple operation. These images are shot by JNOPTIC AcquCAM Pro/G3 camera

3-3-1 Live Pseudo Color (for color camera)

When you get fluorescence images using color camera, if the unwanted channel was shown because of cross talk, you could remove this channel to take advantage of function of Live Pseudo.
Improvement Function about Fluorescence Microscopy Live Camera Image. (Used function: Live Pseudo Color)
arm06
 The extraction of wanted color information from color image (Remove BR on RGB source) These images are shot by JNOPTIC AcquCAM Pro/G3 camera

3-3-2 Live Pseudo Color (for Monochrome camera)

When you get fluorescence images using monochrome camera, you can raise efficiency of acquisition for fluorescence images to add similar false color to the color to be shown on the eyepiece in real time.
Improvement Function about Fluorescence Microscopy Live Monochrome Camera Image. (Used function: Live Pseudo Color)
arm08
 Improvement of usage environment for monochrome camera to add false color on the image. These images are shot by JNOPTIC AcquCAM Pro/S3 camera

4. JNO-MHU(Option Unit)

Available measuring height with additional unit, JNO-MHU
※ JNO-MHU is sold separately as optional unit.
jno-mhu1
  jno-mhu2
 Left: Focus on top of sample (Z-axis reset), Right: Focus on bottom of sample (Z-axis height measurement)
jno-mhu3
 < Measuring condition : over 20x objective, temp 20°C >
Responding Model Measurement value unit Measurable height Error of measuring 1000㎛ Recommended measuring height
CX 41 0.2 ㎛ -9.9 ~ 29.9㎜ Below ±20㎛ Below ± 2000㎛
CKX 41 0.2 ㎛ -9.9 ~ 29.9㎜ Below ±20㎛ Below ± 2000㎛
BX – FM 0.2 ㎛ -9.9 ~ 29.9㎜ Below ±20㎛ Below ± 2000㎛
BX 51/53 0.1 ㎛ -9.9 ~ 29.9㎜ Below ±10㎛ Below ± 1000㎛
MX 51 0.1 ㎛ -9.9 ~ 29.9㎜ Below ±10㎛ Below ± 1000㎛
MX 61L/61 0.1 ㎛ -9.9 ~ 29.9㎜ Below ±10㎛ Below ± 1000㎛

5. Reporting to Excel

excel

 

 

JNO-WI-3

X Y Mover & Bridge Stage

Description
Material  Aluminum
표면 처리  Black –Anodizing
Travel Range (mm)  X    ±12.5     Y    ±12.5
높이 (mm)  170  ~ 220
Tap Hole 규격  M6
Tap Hole 간격 (mm)  X    25    Y    25

JNO-WI-3 (s)

X Y Mover & Bridge Stage (Short column)

Description
Material  Aluminum
표면 처리  Black –Anodizing
Travel Range (mm)  X    ±12.5     Y    ±12.5
높이 (mm)  100  ~ 150
Tap Hole 규격  M6
Tap Hole 간격 (mm)  X    25    Y    25

JNO-CP

Centering Plate for JNO-WI-3

JNO-CP
Centering Plate for JNO-WI-3

XY-MOVER

AcquCAM 23S

AcquCAM 23S

  • USB 3.0 Monochrome Camera
  • 1/1.2 ” Exmor Sensor
  • 1920×1200 pixel
  • Trigger input and I/O

AcquCAM 23S
EXMOR Sensors: Next-generation imaging sensors based on CMOS, increase the strength and reduce noise.

 

High sensitivity camera available from visible to IR range

20151120_1(CA1 pyramidal neuron)
Apply high sensitivity EXMOR sensor with additional filter block visible range, IR Cut filter image could be observed.

 

Available wider range of observation

AcquCAM 23S_6
By applying a 1 / 1.2 ” EXMOR sensor, you can observe a wider range of superior sensitivity image.
These images were shot by AcquCAM 23S Package.

High sensitivity and fast frame image

AcquCAM 23S_(CA3 pyramidal neuron)

AcquCAM 23S_(Dentate gyrus Granule cell)
To maximize the range of imaging possible observation with fast frame 54Fps and high sensitivity 0.015 lx .

[Specification]

SpecDescription
Size1/1.2 inch
ResolutionH: 1920, V: 1200
Pixel sizeH: 5.86 µm, V: 5.86 µm
Video formats

& Frame rate

1920×1200 Y16 @ 25 fps

1920×1200 Y800 @ 54 fps

Sensitivity0.015 lx
Exposure time1/100000 to 30 s
Lens mountC/Cs mount
InterfaceUSB 3.0
Power supply4.5 to 5.5 VDC
DimensionsH: 29 mm, W: 29 mm, L: 43 mm
Mass65 g

 

AcquCAM Pro/S3

AcquCAM Pro/S3

AcquCAM Pro/S3

AcquCAM Pro/S3 USB 3.0 camera is the perfect solution for many bio, industrial, medical applications. Utilizing the very sensitive mono CCD sensors, these cameras feature a specialization of fluorescence observations. With up to 30 fps and a trigger delay of less than 5 micro seconds.

  • 1.2 Mega pixel CCDcamera
  • Monochrome, Progressive scan
  • Preview software provided (JNOPTIC Capture)
  • Software compatible with Windows XP/ Vista/ 7/ 8 operating systems

Apply Pseudo color for live fluorescence

Apply Pseudo color for black live fluorescence

AcquCAM Pro S3_6

Emphasis function for variety images

Getting clear image with general light source

[Specification]

SpecDescription
Size1/3 inch
ResolutionH: 1280, V: 960
Pixel sizeH: 3.75 µm, V: 3.75 µm
Video formats & Frame rate1280×960 Y800 @ 30, 20, 15, 7.5, 3.75 fps 1280×960 Y16 @ 30, 20, 15, 7.5, 3.75 fps
Sensitivity0.015 lx
Exposure time1/10000 to 30 s
Lens mountC/Cs mount
InterfaceUSB 3.0
Power supply4.5 to 5.5 VDC
DimensionsH: 29 mm, W: 29 mm, L: 43 mm
Mass65 g